製麴室是將在地芋頭切丁後蒸熟並分解製作成酒莊獨特的芋燒酎的場所。因為是完全無汙染的地方，因此只能透過窗戶窺探內部，這間無菌室又稱製麴室，在控制適當的溫度(約30°c)及濕度(無固定)下培養微生物，而酒的味道、色澤、澀度皆取決於菌種的培養，一次培養200公斤，所需時間52小時，大安製酒廠的無菌室是採手工製成，當煮熟的米飯放置在麴床上，溫度一旦超過45°c菌種便會死亡，因此需要不定時的幫這些麴米翻動讓它們散熱，雖然手工比較費時也麻煩，但卻也可以避免機器散熱不均勻的問題。此技術取自日本的燒酒，解說員解釋這是因為民國89年才開放台灣民間製酒，因此製酒技術差了國外整整一大截，因此技術大部分都是自國外引進的。
 
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製麴室
