一般水溫上升至20℃以上時，即可撈捕種魚放養，選擇體型大、肥滿度高、體色鮮艷之種魚。捕撈種魚時，水溫不可低於20℃，否則種魚會因捕撈及運搬而受外傷，容易感染水生細菌而使種魚死亡。放養時按雌雄比率為3:1 （每公頃的最適放養量為12,000~20,000尾左右為佳，雌性種魚為9,000~15,000尾，雄性種魚為3,000~5,000尾），任其於潔淨無雜魚之繁殖池中自行交配繁殖。待仔魚孵出後，再將仔魚撈捕集中，養成至體長約2公分作為養殖用種苗。

吳郭魚為口孵魚，意即雄魚在池底挖掘產卵槽，待雌魚前來產卵受精，雌魚再將受精卵含入口中，以唧筒原理（吸水、排水）促使受精卵在口腔內滾動而達到孵化之目的。自產卵至仔魚離開母魚約須時2個星期，加上母魚體力之恢復期，所以產卵週期為3~4個星期。母魚連續產卵4~5次後會有一段時間為休產期。17公分的母魚產卵數約340粒，57公分的母魚可產卵約3,700粒，但實際孵化的仔魚數僅約產卵數的30%。