1.接合菌綱，例如：毛黴、麵包黴。
2.子囊菌綱，例如：酵母菌、冬蟲夏草、羊肚菌、塊菇。
3.擔子菌綱，例如：木耳、茯苓、香菇、洋菇、草菇、及竹蓀等。
4.不完全菌綱，例如：青黴菌。
而這些凡屬於可食用或有藥用價值的菌類，我們管它叫做"食用菌"。
此食用菌即指真菌中能形成大型子實體或菌核，並能供人們食用的種
類。若是有毒而不能食用的大型真菌，則稱為「毒菇」。然而在真菌
的分類學上，絕大部分的食用菌屬於「擔子菌綱」者為多，少數則是
屬於「子囊菌綱」者，而此兩者之間的主要區別在於有性生殖階段，
其『孢子產生方式』之不同；子囊菌綱類有性生殖之孢子著生於子囊
內，常見的有羊肚菌、冬蟲夏草等。而擔子菌綱類的有性孢子生殖，
則是著生於擔子上，其子實體為較大型，常見的有靈芝、白木耳、香
菇等。不過，欲區別此兩種菌類，仍須藉助顯微鏡切片的觀察，方能
得知其真正內幕喔!