往是觀察真菌時唯一看得見的部分，形狀從我們所熟悉的具柄傘形到
多種樣式不等。它們的作用是產生有性袍子，真菌學家即根據產孢方
式將之分為三類，或稱門。
子實體的構造
每種真菌，包括其子實體，都是由稱作菌絲的成團細絲所構成。隱匿
在基質中的菌絲會先形成菌絲體，當環境適合的時候，便從表面長出
子實體。 所有子實體都有一片具繁殖力的區域，也就是產生孢子的組織，稱作子實層，它通常被一種多肉的構造支撐著，例如：蕈柄上的蕈傘。
蕈幕：保護整個或部分的年幼子實體。在成熟的子實體上，
其殘留物呈現鱗片、蕈環或者蕈托。
菌索：孢子在適合的環境下萌發成為菌絲，菌絲和其它的菌絲再一起
結合形成菌索。有些子實體具有粗的菌索，並能固著在隱藏於基質中
的菌絲體上。
子囊菌門
子囊菌的孢子形成於微小的囊狀構造(子囊)中，每個子囊產生8個孢子，並位於子實層內。有些子實層位在子賞體外，例如羊肚菌;或散布在子實體內部，例如塊菌。但亦有許多子囊菌不產生子實體，而是透過無性孢子來繁殖。
擔子菌門
幾乎所有的擔子菌都有子實體，子實層由先端長出小梗(擔孢子梗)的棍
棒狀細胞(擔子)構成，孢子便在梗上形成。每個擔子上通常有4個擔孢子梗，每支梗產生一個孢子。許多擔子菌還可由其菌絲之間的扣子體來和其他真菌區分。