朱一貴亂事平定後，改六隊為六堆，分別為「先鋒堆」萬巒,「中堆」竹田，「後堆」內埔，「前堆」麟洛、長治，「左堆」新埤、佳冬，「右堆」高樹、里港、美濃。除了朱一貴之役外，動員六堆義勇出堆保衛鄉土的尚有；雍正十年吳福生之亂；乾隆五十一年林爽文、莊大田之亂；嘉慶十二年海盜蔡牽之亂；道光十二年張丙、陳辨、許成之亂；咸豐三年林恭、林萬掌之亂；同治二年戴潮春之亂；光緒廿一年抗日等。所有保鄉衛土犧牲的英雄，皆供奉在建於康熙六十一年﹙1722﹚年的忠義祠﹙原名忠義亭，1958 年改建改名﹚，每年由各堆推派組成的忠義祠管理委員會辦理春秋二祭。

六堆嚴密的組織在教育上亦發揮極大的功能，乾隆四十九年六堆舉人何元濂發起文宣會，由六堆一百餘位讀書人集資購田，收取地租，用以祭祀，並在各村莊設義塾，推廣教育，培養讀書風氣。道光六年成立六堆科舉會，為赴大陸趕考子弟提供獎學金，於是六堆地區文風鼎盛，人才輩出，清代鳳山縣出身進士五人，六堆即佔三人﹙美濃黃驤雲、內埔江昶榮、長治張維桓﹚，廿八名舉人當中，六堆佔廿人。

清代各類台灣志書甚多，有關客家之記述由無到有，有所記載亦以負面描述居多，康熙廿四﹙1685﹚年完成的《台灣府志》，康熙卅五年刊行的《台灣府志》及康熙五十一年的《重修台灣府志》皆無客家記述，康熙五十六年完稿的《諸羅縣志》在〈風俗志〉中列有〈客家之俗〉，有今之流民大半潮之饒平、大埔、程鄉、鎮平、惠之海豐」之記載。尹章義認為，康熙末年，除了現今台南一帶，新墾區拓墾者的籍貫結構有所改變，「現在的高、屏地區，已粵籍移民為主而間雜以閩籍移民，現在的嘉義、雲林、彰化和彰化山地的諸羅縣轄區，則大半是粵籍移民，部分為閩籍移民。」這些客籍人士，以來自饒平者居多，如嘉義溪口、大林莆、彰化之員林、埔心、永靖、田尾。亦有來自漳州詔安者，如雲林之西螺、二崙、崙背。亦有部分來自汀州之長汀、永安、上杭、武平等縣者。

李豐楙在〈台灣中部「客仔師」與客家社會─一種社會變遷中信仰習俗的起伏與消失〉一文指出「雲、嘉、及彰三地區的客家移民，從雍、乾直到光緒割台以前，在經歷台灣移民史上的協同、抗爭與再整合後，百年期間內『客仔』及『客仔師』的稱謂消失，實與客民在大變動的處境有關。」這些客家人由歷次分類械鬥，有的撤往台中東勢、苗栗，有的留下成為所謂的Hoklo客。有台灣新文學之父之稱的賴和有詩為證：「我本客屬人，鄉語竟自忘，戚然傷懷抱，數典愧祖宗。」客家先民留在雲嘉彰平原的是達四五十座的三山國王廟﹙彰化縣達三十四座﹚，一座定光佛寺及為數甚多的客家古屋，其中永靖的陳餘三館列為三級古蹟，為台灣十大名宅之一。台中平原及山區之開發亦有許多客籍人士參與。其中大埔人張達京以通事身份主持今台中平原之拓墾，尤功不可沒，其後裔現仍為台中市望族。今豐原﹙舊名葫蘆墩﹚、潭子、神岡等地都曾有大量大埔、饒平、詔安客家移民墾殖，今神岡之筱雲山莊名列古蹟，亦為客家古屋之一。

現今台中地區最大客家聚落是立於大甲溪與大安溪附近之石岡、東勢、新社、卓蘭等鄉鎮。石岡、東勢由大埔人劉啟東於乾隆四十年率眾墾殖有成，卓蘭則由饒平詹姓人士於乾隆中葉大量入墾。九二一大地震，該地區許多開發期中古蹟如劉家夥房，巧聖先師廟等不是全毀便是損害嚴重。

一般說來，北台灣的開發較南台灣晚，移民遷入亦晚，但實際上早在康熙廿年左右，便有客家移民入墾鶯歌、八里，劉正鋼在〈客家與清代西北地區的開發〉指出，「清代客家在台灣北部某些社區的開發中往往具有先趨者的角色。」現今台北縣市許多地方本由客家人開闢，但皆因人口數不足，發生械鬥後遷移。客家人在台北大規模墾殖有成者，依尹章義的研究，應是新莊平原的開發。

在〈閩粵移民的和與對立〉一文中，尹章義據開墾的字據指出，當時的興直莊﹙即今之新莊、五股、泰山一帶﹚是汀州貢生胡焯猷帶頭開墾，他在乾隆十七年﹙ 1752 ﹚獻地在興直山西雲岩建大士觀，後人稱八里坌山為觀音山。 1761 年胡又在新莊創建關帝廟， 1763 年捐水田八十甲辦「明志書院」。做為雍正、乾隆年間北台灣的政經社中心，新莊街有三座宏偉的廟宇─Hoklo人 1731年建的慈佑宮奉祀媽祖，胡焯猷 1761 年倡建關帝廟時有「廣東嘉應州鎮平縣人張將錫口庄﹙今台北松山﹚田園獻於廟內以為香祀之資」。乾隆四十五年﹙ 1780 ﹚粵人捐建國王廟，即廣福宮，該廟之建造與潮州籍移民在台北平原勢力極大的劉姓家族有關，該家族劉和林三代人開鑿「萬安坡大圳」，於 1763 年完成，貫穿整個新莊平原，總灌溉面積約一千三百甲，客屬潮州移民財力大增，乃有三山國王廟之建立。後因道光年間械鬥，客家人南移桃、竹、苗，該廟香火即衰， 1882 年毀於大火， 1888 年方由新竹新埔潮籍士紳陳朝綱等捐款重建。

芝蘭三堡即今之淡水、三芝、石門等鄉鎮，廖倫光在〈芝蘭三堡汀州客家聚落與領域層次之聯繫〉指出「自從清初康熙年間，閩粵先民帶動移墾芝蘭三堡 … 客屬即由初墾時期移居性草寮陋屋 … 繁衍達到庄社建制的規模。隨後進展至乾隆末年 … 各籍客屬墾民，在八連溪以來，流佈及整合為綿延的集村與散村叢聚；並且建立 … 豪宅大厝，據此做為庄社發號施令的中心與象徵。徵最後，時至清季中葉，持續擴大客屬生存活動的空間範圍。」隨著汀州移民人口的增加，乃有汀州人士於 1871 年在今淡水﹙舊名滬尾﹚建鄞山寺，奉祀汀州守護神定光古佛並兼作汀州會館之用。依文獻記載，開發三芝、石門之江、陳、謝、許、陳、潘、鍾等姓氏族人皆來自汀州府之永定，江家子孫繁衍至中和，成為中和地方人，而開發中和的游姓家族則是來自詔安二都秀篆的客家人。

現今客家人聚居的大本營─桃、竹、苗，比較起來，開發較晚。康熙卅六年﹙ 1697 ﹚郁永河北上採硫磺，在其日誌《裨海紀遊》中謂「前路竹塹、南崁，山中野牛甚多，每出千百為群 … 自竹塹迄南崁八九里，不見一人一屋，求一樹就蔭不得。」至康熙末年才有少數客家移入。雍正、乾隆年間客家移民大量移入此區，加之彰化、淡水、新莊先後械鬥，驅使更多客家人移入此區。

桃園台地屬石門沖積扇礫石層，泥黃土貧瘠，又無大川灌溉，開墾條件不佳，客家移民充分發揮灌溉技術，挖掘出許多的「陂塘」，化貧瘠之地為肥美的田園。傳統上說，桃園是南客北Hoklo區，南區包括中壢、龍潭、平鎮、楊梅、觀音及新屋等市鎮。除靠海的觀音、新屋地區講海陸外，其他地方以講四縣為主，少數地方講饒平。平鎮市的褒忠祠義民廟建於乾隆五十五年。龍潭的聖蹟亭，建於光緒年間，原為焚化字紙之惜字爐，格局優美，列為三級古蹟。

新竹縣客家人口佔百分之八十左右，除沿海的香山及新竹市外，其他鄉鎮大約皆客家市鎮，竹北、新豐、湖口、芎林、竹東、橫山、北埔、峨眉、寶山等鄉鎮講海陸為主，新埔、關西部分講四縣，少數地方講饒平。相較起來新竹地區保留有相當多的墾拓古蹟，比較出名的有北埔的姜家天水堂，為三級古蹟，金廣福為清政府，Hoklo人客家人聯手開發山區的辦公室，為一級古蹟，但已殘破不堪。

新埔坊寮義民廟是臺灣客家人信仰中心。據新竹縣文化局出版的義民心，鄉土情《褒忠義民之史專輯》記載：乾隆五十一年（ 1786 年）林爽文起事波及全臺，當其以王作為首的北路軍部眾攻陷竹塹城後，因「行軍必先行糧」，繼續往北第一個要拿下的就是米糧富庶之地的六張犁（竹北六家）。

當時，北路軍所到之處燒殺劫掠…為抵禦林爽文來勢洶洶的軍隊，由林先坤出面邀集各庄頭的劉朝珍、陳資雲、錢茂祖、王廷昌、黃宗旺、吳立貴等，共同組成保衛鄉庄的隊伍，這一批由子弟兵、長工臨時組織起來的義民軍共有一千二五多人。作戰時以黑布圈綁在臂上作為識別。經過慘烈激戰，義民軍不僅成功擊退亂軍，且在壽同春的帶領下，與竹塹城內閩南籍人士組成的義軍共同收復竹塹城，之後兩軍並與平埔族義軍並肩南下協助清軍平亂。當義民軍奮勇擊退林爽文的軍隊，打道回鄉時，沿途看到綁上黑布的犧牲者即抬上牛車一起運回，並預定葬在大窩口（今湖口鄉附近）。當車行過到枋寮義民廟現址時，牛車離奇地停頓不前，一行人決定焚香禱祭並跌筶探問原委，經過三次的勝筶（聖筊）始確定。

義民廟成於乾隆五十五年（ 1790 ），奉祀二百餘先烈忠魂。同治元年（ 1862 ）戴潮春事件，再組義軍，戰歿義軍百餘人忠骨葬於原義民塚旁，即「附塚」。原廟於甲午戰爭毀於戰火， 1904 年由客庄居民捐資重建落成。建廟初期，義民廟只有少數戶祭祀，後來漸漸發展出值年經理制，?理廟產，辦春秋二祭及中元祭，祭祀圈涵蓋桃竹十五大庄，並隨著客家移民的擴散，分香至各地，依枋寮義民廟臺灣區褒忠義民廟聯誼會統計，全臺有三十四座－桃、竹、苗共九座，南投、嘉義共十二座，高雄、屏東共六座，花蓮、臺東共七座。

事實上，義民信仰並非只有客家人獨有，林爽文事件在諸羅縣各戰役甚為慘烈，事平後，諸羅縣改名為嘉義縣，縣城東門有主祀「十九公」之忠義祠，南門有主祀「義民公」的鎮南祠（護國義民祠），而當時縣丞所在的笨港，亦有義民祠，現今太保市七月亦有「義民」祭祝。（見邱彥貴＜從祭典儀式看北臺灣義民信仰＞）。但客家義民廟的信仰卻成為客家族群認同的標誌，影響甚大。