挑戰2008國家發展重點計畫的提出 
民國91年(2002)，行政院為因應全球競賽的挑戰、大陸磁吸效應的衝擊及改革舊有體制，協助經濟快速升級與轉型，
行政院在91年5月核定「挑戰2008：國家發展重點計畫」。
這個計畫除了進行政治、金融、財政改革外，並提出十大重點投資計畫，預估6年內共要經費2654484億元。主要目的在提升台灣知識與創新能力，除繼續發展高科技產業外，並充分利用在地資源，發揮在地文化特色，以創造台灣特有的競爭力優勢。期望能創造經濟成長、創造就業機會、提升生活品質，並可強化農、漁民及勞工等弱勢團體福祉與權利。
蘭花生物科技園區所列屬計畫
依據民國92年(2003)1月修訂的「挑戰2008：國家發展重點計畫(2002-2007)」一文所記敘，在十大重點投資計畫中，第四項為產業高值化計畫，主要策略是共同募集創投基金、協助開發產業核心技術、推動重點產業、獎勵投資開發國際通路及品牌、勞動力升級及開發建設產業園區等六項。
在開發建設產業園區方面主要就是由政府提供產業發展基基地，其中包含設立花卉生物科技園區，主要為整合既有花卉產區，結合當地觀光休閒資源，提升花卉產銷及研發機能，以增加台灣競爭優勢，蘭花生物科技園區一案就屬這一項，由農委會所負責。
園區計畫通過和設立
蘭花生物科技園區屬地方主導型園區，主管
部會為農委會，這項計畫經農委會於91年(2002)12月報行政院轉交經建會審議，並於92年(2003)2月獲得結論，行政院於92年(2003)2月25日核定。
同年(2003)5月2日，縣政府就與台糖公司簽約承租位於台南縣後壁鄉烏樹林段台糖公司之樹安農場，依規劃總共要開發200頃，租期20年，將以6年5個開發期完成全區建設，預計將投入20.6億元。93年(2004)2月20日，陳水扁總統親臨主持園區舉行動土典禮，宣示蘭花產業將與國際接軌。目前公共設施工程、營運服務中心、環保能源中心、生產示範溫室、國際花卉展覽中心及景觀工程等多已完工，營運服務中心並於93年(2004)12月21日正式開幕啟用(92年即有派駐相關人員服務)，縣府團隊正式進駐。目前園區亦已完成兩期的招商
。
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