在這國家公園的範圍內，因為有充足的地熱資源，溫泉遍佈。

　大屯火山群的溫泉區，其溫泉水可分為三類：

　第一種稱為酸性硫酸鹽氯化物泉，俗稱青磺。是地下水中滲入火山氣體，經酸化後混入少量地表水而成，其特徵是溫度高可達沸點且酸性強，例如馬槽溫泉地熱谷溫泉等。

　第二種叫做低濃度酸性酸鹽泉，主要成因是地底蒸氣冷凝而成，俗稱白磺，溫度約在攝氏60到80度之間。

　第三種溫泉是低濃度中性碳酸氫鈣泉，由地下水間接加熱而成，多半生成於離火山較遠的低溫帶，俗稱鐵磺水水溫在攝氏四、五十度左右，如頂北投的龍鳳溫泉、鳳凰溫泉等。