除了海洋生態系不平衡造成的海洋環境改變，有許多海洋環境的破壞，是來自於破壞性的漁法。破壞性漁法導致魚源稀少，魚源稀少又引發使用破壞性漁法竭澤而漁討生活的動機，如此惡性循環，從大魚一直捕到小魚，直到一條魚都活不下去，實在是生態浩劫。

底拖網漁法會破壞海床表層，在拖行過程中亦對不少固定在海底生活的生物構成傷害。珊瑚礁與軟體珊瑚成為底拖網捕魚的犧牲品。由於使用底拖網並不違法，以致豐富的海洋資源不斷遭受破壞，這些珊瑚再度集結生長的機會也減少許多。

毒魚的方式是將毒藥(如魚藤、氰化鉀、氰酸鉀)投入河中使魚蝦暴斃或昏迷之後再收成，一次捕魚的收穫可能多於十艘漁船一天的總魚獲。毒魚新聞幾乎每年都有數起，雖然警察都有嚴加查緝，但是仍然無法使其消失，因為毒魚的收益實在太誘人。以下是一則2011年的毒魚新聞摘要:

  圖片來源：http://fishdb.sinica.edu.tw/picdictionary/674-Danish%20seine-%E5%BA%95%E6%8B%96%E7%B6%B2.gif