坪頂古圳歷經清領、日治時期，其樣貌延續至今，水圳在管理上，不同時期是由不同組織傳承。但主要任務同為提供當地農田，質優量豐的灌溉用水，目前坪頂古圳由臺北市七星農田水利會全權負責管理維護。有鑑於此處規劃為陽明山國家公園及保護區內的水圳，自民國八十八年起，水利會在損害維修、於各項水道設計上，更將生態納入考量，讓水圳的改善及管理能兼顧三生（生態、生活、生產），期望創造友善自然的水利生態環境，及源源不絕的灌溉用水，供當地居民生活。(e)

三、災害防救
       每年三月水利會擬具災害防救計畫，四月底完成設備檢修及講習演練，當災害發生時，人員能有條不紊的執行災害防救工作。 另將遠端監控及自動化設備導入災害防救體系，可隨時透過遠端監控掌握現況，若有緊急情形立即派人處理。像是八仙圳西安街電動攔污柵、水磨坑溪及關渡農田 排水抽水站，都建置了遠端監控設備，在颱風季節及防汛期間，讓七星農田水利會可達到「遠端監看、立即處理」的目標，提升工作效率，減少災害發生。

四、設施改善
      水利設施改善除考量灌溉、排水等通水量斷面需求外，並將生態、環境美化、減災、防災及後續管理維護等因素納入設計規劃之範疇，因地制宜，提出最合適改善方案。(f) 

       從上述內容可以得知，水圳維護核心在於注重水質是否清澈，與水道排水是否順暢。在七星農田水利會具系統、效率的管理下，讓坪頂三條古圳能長久維持其樣貌，持續為當地居民給予乾淨的水源。