玻璃廟係以筏式水泥基座結合鋼骨作主結構，而後再運用高科技隔熱安全玻璃作屋面 及外牆材質，進而以木雕、石雕精品，融合彩繪窯燒、熱塑、堆疊玻璃執行內裝修飾，多元文化及藝術創作匯聚構築而成，強度可耐八級地震，十七級陣風。

  廟內供奉主神為琉璃媽祖，神銜為〝普濟群生．仁慈天后〞係奉玉旨欽命，融合1.莆田祖祠地、 2.血脈出生地、3.得道升天地、4.官府首香地、5.渡台開基地，海峽兩岸五方聖母，集靈合體演化而成，主要任務為「廣佈德澤、聞聲救苦、慈悲為懷、 度化眾生、移風易俗、淨化民心」 。護聖宮仁慈天后入火安座後，將為台灣的宗教信仰導入另一個新的里程碑。

  玻璃廟自西元2007年動土興建後，至今已歷五個寒暑，全部工程預定於2011年九九重陽節完成。 於2012年國曆3月31日由馬英九總統親臨主持入火安座大典，同時點亮八卦天燈後，正式開放全國信眾自由參訪。

  玻璃廟以產業技術融合文化創意、宗教科儀，塑造出玻璃神轎、玻璃媽祖船，這一切的努力， 無非是想藉由團隊力量打造世界級的觀光新景點，藉以凸顯台灣之美，進而行銷國際。