由於溼地環境提供了鳥類豐富多樣食物來源和棲息處所，因此馬太鞍溼地的鳥類族群種類繁多，其中尤以鷺鷥科的鳥類最為常見。在水澤中或荷田裡，經常可見白鷺、栗小鷺、黃頭鷺、黃小鷺和夜鷺等，耐心地尋覓水中的魚蝦或活躍於草澤間的各種昆蟲。

碩大濃綠的荷葉上則經常可見麻雀、白腰文鳥和斑文鳥們活潑跳躍的身影，水中的水棉是牠們的最愛。

此外，這裡也是紅冠水雞的育兒中心，尤其春、秋兩季常有許多紅冠水雞家族，在荷田間穿梭覓食，好不熱鬧。至於冬季休耕的田地上則是田鷸、白腰草鷸的大食堂，只要細心觀察就不難發現牠們。難得的是，前幾年也曾在荷田間出現水雉的蹤影。而緋秧雞也經常在菱角田出現，尋覓躲在菱角葉下的蜻蜓幼蟲。

走在溼地的步道上，小卷尾雄糾糾地停在電線上，一點也不懼怕遊客的驚擾，馬錫山坡的林木間有花蓮縣鳥─朱鸝留連，天空中也經常可見盤旋的大冠鷲，還有從中高海拔下降前來避寒的白耳畫眉和鶇科的鳥類，以及從中國東北前來度冬的紅尾伯勞。

無論山邊或水澤，這裡的鳥況都很好，非常適合從事賞鳥活動。

• 馬太鞍生態導覽手冊  花蓮縣光豐農會出版 p.16 - p.17