慈雲寺的歷史可追溯到民國八年，此時正處阿里山初期開發之際，由於1915年森林火車出軌死傷五人，1919年總督府鑒此，又對印度的「靈鷲山」聖地有所感，便請託設立廟宇，遂建造此一寺，命名為「阿里山寺」，為台灣少數日式獨棟木造佛寺。並且由當時成為曹洞宗佈教，置一暹羅國王欽贈的釋迦牟尼古佛像一尊，主祀釋迦牟尼佛，佛像內部裝入金沙，外表則加以銅鑄，造成時間已有千年之久，相當的珍貴。後來，一直到了民國三十四年台灣光復後，便正式更名為慈雲寺。慈雲寺是一個很清幽的地方，寺裡的香火裊裊，予人一種莊嚴肅穆的精神力量，周圍種有不少花木，還有幾棵銀杏樹，把整個園子裝點的相當別緻，純木造的廟宇，有種日本的異鄉韻味。另外寺旁有一座鐘塔，更增添了一種超脫的佛老情懷。慈雲寺更有居高臨下的好地點，於此，周圍雲海蓬肆，霧氣茫茫，是觀賞雲霧另一佳點。

*徐守國題阿里山慈雲寺

此地崇山峻嶺，茂林修竹，最奇雲海大觀，蔚為人間勝境；

到處明月清風，流水激湍，雖無蓬壺仙跡，堪稱島上洞天。

　　園址位慈雲寺及博物館間，總佔地1920平方公尺，內為高山植物園，植有溫帶樹木十餘種，是一個可以深入了解植物的小天地。此處仍保有日式造園的痕跡，天然的綠樹小徑，滿是綠意。

　　 阿里山博物館如圖片所示為一紅色木造建築，建造期可溯至民國元年，建立之初係展示阿里山所有植物以及日本學者在阿里山山區的植林規畫。後來臺灣省林務局接收後，便重新整治進而轉變展示內容，改由展覽阿里山早期開墾之機器用具與高山動植物標本，另外亦有當地原住民鄒族的傳統服飾用具，是一個可以深入了解本地的博物館。可說有相當重要的史跡保存價值。

　　 展覽室共四部份：入口走廊，以及前、中、後各一室。於入口走廊處，展覽的是阿里山開發初始所用之美、英及日製橫切鋸、早期集材機模型、阿里山森林遊樂區當年規畫模型，另有一塊巨型紅檜橫切面，上面分別依不同的年輪標出宋、明、清各朝代年數，此木塊年齡估計為八百三十五年。

　　 阿里山高山博物館座落於阿里山賓館的西南方，步道可達，以往的開放參觀時間是每日的上午八十至十一時，下午二時至五時。而且是完全免費入場。不過由於九二一地震，便棄置，目前仍無重新展示跡象。

參考資料：
１．阿里山森林遊樂區導覽手冊／林務局嘉義林區管理處