普羅民遮城（赤崁樓）

　　早年赤崁樓的基地上曾先後出現過五幢建築物，如今只剩下文昌閣、海神廟及蓬壺書院之大門。另外尚有不少古蹟陳列其中。

今日的文昌閣

　　文昌閣與海神廟皆屬於「歇山重簷式」之三層樓建物，其上下簷間夾有一層屋身，是頗富變化之設計。屋頂簷角極長，尾端變為鯉魚翻躍的藻飾，外形華麗卻不失生動活潑。

　　另外位於赤崁樓西北側的蓬壺書院門廳，為典型閩南式建物，兩邊以斗仔砌砌出的紅磚牆，配上綠釉花窗，充分展現出雅緻卻不失沈穩的風貌。正門上方懸有沈受謙所題之「蓬壺書院」門匾，四面牆上則有「雲路」、「立雪」、「霄窺」、「鵬程」等垛匾，除了可激發學生苦讀外，也讓整個門廳更有書卷味。

普羅民遮城的城堡舊門

　　至於三百年前普羅民遮城之遺跡，赤崁樓內尚保有二處。一為文昌閣台基下方之城堡舊門，是日人於1942年拆除大士殿時所挖掘到的。由於顧及基台上建物的安全，挖掘的深度只及文昌閣屋椽七、八尺深，但已可以看見門內上樓之石階痕跡及拱門等。

普羅民遮城的稜堡殘蹟

　　另一處在文昌閣左側，為普羅民遮城稜堡之殘餘。由一塊塊紅磚堆砌出來的厚實牆垣中，有一方凹洞，可能是昔日砲座之所在。除此之外，海神廟與文昌閣間有一口半月形古井，相傳鄭成功圍普羅民遮城時，荷蘭守軍即由井內祕道逃至熱蘭遮城。但是由於兩城相距六公里，聽起來令人難以置信，且經挖掘後，亦無祕道之遺蹟，因此恐係街坊傳說而已。

海神廟旁的御碑贔

　　海神廟旁的御碑贔是清乾隆皇帝為了獎賞平定林爽文事件之有功人員，特地親題詩文，再以漢文及滿文刻於石碑上。石碑底座以石材雕刻成像烏龜的動物－贔屭，代表祥瑞。