行政院院長張俊雄到新莊聽取捷運系統簡報，並指示衛生署協助本院拆遷整建事宜。樂生療養院院方行文台北縣政府陳情：希望鑑定樂生療養院的古蹟價值。遭縣政府駁 斥，文化局未啟動古蹟審查程序。

因捷運工程展開徵收拆遷病舍，內政部營建署完成新建新醫療大樓發包。文建會於七八月間召開緊急協調會議，參與會勘學者一致認為樂生院具保存價值。各方不斷協調後，政府決定採拆遷重組方式保存小部分建築（七星舍與行政大樓一部分），仍未確立樂生院之古蹟地位。由社區大學組成之樂生老樹聯盟，將院內百棵老樹完成樹種調查與認養。

*增設「迴龍門診部」提供對外門診服務，積極走入社區服務，位醫院轉型準備。
內政部營建署完成本院新建新醫療大樓發包工程。因捷運徵收拆遷病舍，目前病舍數31棟 (包括組合屋6棟)。

由全國各地的醫學生主辦兩天一夜的營隊，之後組成了「青年樂生聯盟」，舉辦「回首痲瘋百年：樂生院歷史與空間國際研討會」以及樂生院導覽活動。由新莊社區大學、滬尾文史工作室和北投生態文史工作室舉辦兩場「民間古蹟會勘」記者會，希望北縣文化局儘速進行「樂生院古蹟審查」。

*國際麻風五十週年，結合希望之翼在本院擴大舉辦向「抗癩鬥士致敬」，邀請陳總統水扁蒞臨迴龍新院區致詞。

日本眾議院通過「漢生病補償法修正案」，賠償對象擴大至台灣樂生院戰前院民。台灣漢生病友赴日打贏日本國賠官司。提出樂生院與捷運的共構方案，學生、人權團體舉辦各種音樂、文化活動，院民與學生在總統府、文化局、衛生署前抗議。6月11日數百人的大遊行、7月26日至29日在國民黨部前絕食靜坐四天。北市捷運局與北縣府自行提出保留41.6%的方案，強迫院民搬遷至並不適合他們的醫療大樓。12月，樂生院被暫定為古蹟，「保存期限」為期只有六個月，但是在這半年期間，文建會卻沒有進行任何的古蹟審查。

*衛生署侯署長勝茂到院關心院民。
*新莊市龍福里、樹林市及龜山鄉民遞交連署書，要求本院早日展開急性醫療作業，以嘉惠社眾。

*慶祝 76 週年院慶暨迴龍院區啟用典禮

2月5日，文建會呈行政院由英國工程顧問公司提出之「樂生保留90%案」。3月3日，行政院回文表示「奉示」依照40%案進行。90%方案未經過任何公開審議的程序，行政院完全黑箱作業。3月6日，北市捷運局要求院民於7天內搬遷。院民與學生於行政院院長蘇貞昌官邸前靜坐，幾日後又以「六步一跪」方式繞行官邸，企求行政院公開審議90％樂生保留方案。遭到強大警力包圍，將學生全數架上警備車帶離，並將其丟棄在內湖山區。蘇貞昌改以「這不關行政院的事，你們找錯人了。」回應。3月16日，北縣政府派遣200名警察進入樂生院張貼拆遷公告，限期樂生院民於4月16日前自行拆遷。激發部落客、社團群起搶救，促成415挺樂生大遊行。415大遊行之前，蘇貞昌到訪樂生院，表示以保留90%為最大努力。縱然日前蘇貞昌態度軟化，將案件交由公共工程委員會處理，但是強制拆遷的公告仍未解除。在行政院沒有實質善意的情況下，樂生院目前還是處於倒數的危急狀態。

*首次新院區醫院評鑑合格通過。

*社區健康中心成立。
*「漢生病病人人權保障及補償條例」公布施行。
*97 年度台北縣政府衛生局居家護理所護理督導考核：績優。

*台北縣政府衛生局病人安全推動優良醫療院所督導考核：績優（第二名）。
*衛生署北區區域聯盟醫療品質競賽 - 品質改善類：佳作獎。
*衛生署北區區域聯盟醫療品質競賽 - 創新、創意、感動服務類：優等獎。
*文件會通過將本院增列為台灣申請世界遺產潛力點。
* 通過行政院衛生署國民健康局「全國無檳榔醫院」認證。

*台北縣政府公告登錄為「文化景觀」及「歷史建築」。

隨著捷運新莊機廠持續的施工，工程邊坡不僅不穩定造成樂生療養院舊院區開始出現裂縫並持續擴大。

*北京痲瘋協會-漢生照護交流。

*元月樂生橋完工通行。

1月，捷運新莊線「分段通車」到輔大，證明機廠工程對新莊線的通車並無影響。07年曾被否覺得「分段事件」方案並非不可行。

8月，監察院對捷運新莊機佔用樂生院所在地提出糾正案。