將軍溪,又稱古曾文溪、灣媟芊A舊名漚汪溪,以前曾是曾文溪下游入海河道,但在1823年(道光三年),曾文溪因山洪而改道,改由西港南流入台江內海,但將軍溪也因而失去了上游的水源。


圖1:17 至18世紀南瀛海岸線圖。(本圖版權屬《南瀛探索》
)

  目前將軍溪的發源地為台南市六甲區之集水大渠,而河水的來源大多為區域性的排水。從上游到下游總共包含了六甲、官田、下營、麻豆、學甲、佳里、北門及將軍等八個區,最後在將軍區的蘆竹溝北岸出海,全溪的總長為24.2公里、流域的面積有16,918公頃、集水區的面積有211.97公頃。


圖2:將軍溪流域位置圖 ( 本圖版權屬 Google Map , 2011)