屏東慈鳳宮創建於清朝乾隆2年，即公元1737年， 迄今已近270年。乾隆11年（公元1746年），阿猴媽祖的信眾愈來愈多，草創時期的廟宇已不敷所需，地 方仕紳鄭峙鼎等人於是發起捐款，在目前媽祖廟的所在地興建殿堂式的木造建築。後來稱為「舊媽祖宮」。

　　根據乾隆29年的「重修鳳山縣志」。當時的慈鳳宮被稱為「鳳山縣阿猴街天后廟」，從那時候起，阿猴媽祖即與阿猴城的發展密不可分。道光5年（西元1825年），信士郭先桂先生倡議以磚牆改建，並以聖母「慈心濟世、鳳德化民」的宗旨，定名為「慈鳳宮」。光緒7年（西元1881年）御賜「阿猴街慈鳳宮」，奠定了慈鳳言在阿猴城的地位。

　　慈鳳宮在改為磚瓦建築後，在清末漸漸成為地方民眾的信仰中心，一直到日治時期（公元1919年），當時的地方人士戴連宗、蘇雲英、林英良等人再度募款，展開慈鳳宮時代的第一次重修。從這次重修之後，慈鳳宮總算初具現今的規模，戴連宗先生並成為慈鳳宮的管理人。

　　 民國47年（西元1958年）慈鳳宮首度成立管理委員會，由唐榮銅鐵廠的老板唐榮先生，出任第一屆主任委員，民國49年慈鳳宮即全力籌備第二次重修，第一期工程主要以問拆前殿為主，民國52年由於唐榮先生過世，由屏東市名醫李朝欽先生遞補為第二屆主委，繼續推動第二期工程。

　　 一直到民國54年才進行問折後殿的第三期工程，同時整修佛祖大殿及左右配殿，增建廟前 的康樂台等，前後總計花了10年的時間才完成二次重修的全部工程，此時的慈鳳宮展現建廟以來最具規模的面貌。

　　 慈鳳宮的宮址在清朝時代是「台灣府南路下淡水鳳山縣港西中里阿猴街」，日治時代改為「台 灣高雄州屏東街新街1小段179號」，如今是「屏東市崇禮里中山路39號」，從住址的改變，可看出行政區域不斷改變，從鳳山縣、高雄州再到屏東縣屏東市，不過慈鳳宮在民眾的心目中地立始終不變。