一、相傳故事

1.千里眼與順風耳

據說千里眼與順風耳倆兄弟乃商朝紂王手下部將，兄名為高明，能見到千里以外的事物，弟名為高覺，能聽見千里之外的聲音，武王伐紂時兄弟二人皆戰死，死後魂魄駐留桃花山成為精怪，為害世人。一日媽祖路過桃花山，倆兄弟出現阻擋媽祖去路並且強逼媽祖與之成親，於是媽祖與二人展開決鬥，最後千里眼與順風耳敗戰，被媽祖收服成為駕前部將。由此可知，媽祖因法力高於千里眼、順風耳，而能收服其為部將，此一意義在於凸顯媽祖的神威，賦與其更高的神力；且兩位部將各具有超人的「眼力」與「耳力」，得以協助媽祖救助眾生。

2.大道公與媽祖婆的戀情

民間傳說大道公與媽祖婆原係一對戀人，當大道公迎娶的花轎抵達媽祖家中之時，媽祖見母羊生產之痛苦狀，萌生悔意，毅然退婚；大道公無故被拋棄，心有不甘，於是每當媽祖婆誕辰遶境時，就施法降雨意圖淋下媽祖臉上的脂粉，媽祖也不甘示弱，每逢保生大帝出巡時，即施法颳風吹落大道公頭上的帽子。因此民間有「大道公風，媽祖婆雨」的諺語，意謂大道公誕辰（農曆三月十五日）都會颳風，媽祖誕辰（農曆三月二十三日）就會下雨，顯示二人鬥法。
其實農曆三月正值梅雨季節，颳風、下雨乃自然現象，然而大道公與媽祖婆鬥法的故事反映民間豐富的想像力，此一傳說係將大道公與媽祖婆從人世間的愛情糾葛，轉至神界的法力交戰，而兩位神祇呼風喚雨的能力，更是海洋文化的表徵。

3.姓林的媽祖顧子孫

媽祖比較照顧林姓信徒，乃因屬本家之故，如逢危急之時，媽祖將會優先援救林姓子孫。此一傳說則可加強宗族力量的凝聚。

4.媽祖接炸彈

據說二次世界大戰末期，美軍轟炸臺灣各城鎮，某日一架美軍轟炸機正執行任務，當飛機飛抵臺灣上空，飛行員竟然見到一位女子佇立在雲端，以裙襬將轟炸機所投擲炸彈撥開，於是炸彈落在外海，沒有造成傷害，事後美軍飛行員提起此事，民眾才知道是媽祖昇空攔截炸彈，拯救民眾性命。此外媽祖廟宣稱，廟中媽祖神像外袍焦黑，就是媽祖接炸彈所造成。關渡有此一傳說。
假如此說屬實，則政府便不必採購防禦飛彈，祇要在各地多建媽祖廟，如中國再以飛彈攻臺，就請媽祖昇空攔截即可，不必再向外國採購武器。媽祖昇空接炸彈當然祇是神話，且投擲炸彈時有未爆彈也不足為奇，而民眾深信媽祖化解危機，乃是對戰爭的恐懼，假藉媽祖接炸彈的神話，撫慰心靈克服恐懼。

5.媽祖分開溪水讓香客穿越

通霄白沙屯媽祖和彰化南瑤宮媽祖，都有媽祖顯靈分開濁水溪之溪水，讓進香客安全通過的傳說。
據說在某一年進香團往北港進香，當時西螺大橋尚未興建，進香團返回途中須渡越濁水溪，適逢大雨不停溪水暴漲，進香團無法渡過，此時濁水溪忽然從中分為兩半，讓進香團順利穿越，待進香隊伍通過之後，才又恢復合流。

6.兒童死而復活的神蹟

有一女性香客揹著兒子（或曰孫子）一同前往，在進香途中其子（或孫）因中暑突然暴斃，女香客不得已祇得暫時將其屍體放置在廟後草寮中（或曰樹林下），待進香返回時再做處理。不料回程時竟遍尋不到其屍首，女香客無可奈何祇得趕回家中，待其返抵家門，竟見其兒（或孫）正在門口遊玩。詢問其經過，孩童說是有一位阿姨帶他回家，乃知是媽祖顯靈讓小孩死而復活。眾所皆知，人死當然不能復生，此一神蹟乃表示媽祖之神通廣大，能使死者復活。

7.媽祖故事的起源

在宋朝福建蒲田湄州，孝女林氏為救父落海，身負父屍漂流至福建南竿島，島上居民感其情操，將其厚葬並建廟祀奉，這是流傳在馬祖地區，媽祖林默娘的故事，而在南竿島馬港天后宮旁的土丘平台（另有一說是鐵板天后宮）下，仍就保存著媽祖漂流至南竿的衣冠塚。

二、歷史