明鄭至清代，台灣政經的重心是在台南府城，而寺廟為佛教弘傳的中心，故無論明鄭或清代，整個台灣佛教的發展都是在今台南地區。

　　但隨著移民的開墾逐漸的由南往北，才形成所謂的「一府二鹿三艋舺」。距離清領台已屆半世紀，台北最古老的寺院艋舺龍山寺，始建於乾隆三年(1738年)，而一年後（1739年）由謝建賢捐資創建的凌雲寺也矗立於淡水河畔的觀音山上，後來才陸續有福建省鼓山湧泉寺的高僧省源和尚於乾隆十七年(1752)建立的淡水廳八里岔堡西雲巖寺的建立。嘉慶十六年(1811年)西雲寺第一次重修，劉建昌義捐埔園及山下渡船，做為西雲寺內香燈費用。 也就是說台灣政經重心的變化是與各地通商港口的開闢有關，而1860年之後的淡水河開港，讓台北地區逐漸取代台南與鹿港，成為政經重心。

　　在清朝末葉 相傳觀音山山區地方糜爛，凌雲寺為宵小竊據，匪徒潛匿為窟，時常出擾。劉銘傳撫台剿平而焚之，經地方人士集資就原址重建。

　　在清領時代結束，進入日據時代之際，觀音山上的三座主要寺廟－西雲寺已歷經三次重修，而凌雲寺曾遭暴風雨損壞，實際存在狀況不明。凌雲禪寺則是理明禪師與寶海法師來此搭茅蓬隱修，未具規模。

參考資料：五股志、臺灣佛教一百年