明清時期，鼓、鑼、鈸已不但有機會結合在一起，自成體系，被廣泛應用於戲曲伴奏之中，而且，獨立和相對獨立地參與社火、廟會、祭祀等場合的演奏了。同時，出現了記錄鑼鼓譜的狀聲字譜，其樂隊編配和組織結構也形成了自身的規律。

　　在當時盛行的南北曲的伴奏中，根據記載共有十七種樂器，其中打擊樂器就有十種，包括「板」、「單皮鼓」、「荸薺鼓」、「雲鑼」、「小鑼」、「大鑼」、「湯鑼」、「大鐃」、「小鈸」、「木魚」。這說明，鑼鼓樂的編配已經齊全，並成為伴奏樂隊中的一組獨立的演奏組織。它雖然還處於配合鼓板、弦子、笛和笙四種主要伴奏樂器的從屬地位，但它畢竟自成體系，有了字譜，並成為南北曲伴奏樂器中必不可少的一個組成部分。

　　繼南北曲之後，繼續產生的其它劇種，如湘劇、川劇、京劇等，也多採用了鑼鼓樂器伴奏。在明末至清末，新興的聲腔和劇種中，如當時影響最大的弋陽腔、梆子和皮簧，也都使用了鑼鼓樂器伴奏，並且進一步更加完善，這種情況一直延續至今。鑼鼓已經成為我國民族戲曲音樂中的重要組成部分。

　　戲曲中的鑼鼓，為廣泛流傳的民間鑼鼓奠定了基礎。 例如陜西鼓樂，鼓、鑼、鈸三大家族有機結合，自成體系，獨立地進行大段演奏。就其樂隊組合來看，其中包括四種鼓(座鼓、戰鼓、樂鼓、獨鼓)，四種鐃和鈸(大鐃、小鐃、大鈸、小鈸)和四種鑼(大鑼、馬鑼、玎鐺、雲鑼)。就其演奏的樂曲來看，已形成了大型鼓樂套曲形式，在結構上分為前後兩部分，每一部分都由鑼鼓樂段引起，中間是管樂吹奏，最後再以鑼鼓樂作結束。前部分用小鑼鼓，即樂鼓、梆子、雲鑼等，後部分用大鑼鼓，即座鼓、戰鼓、大鑼、馬鑼、鐃、鈸等。十番鑼鼓雖然是絲竹與鑼鼓相結合的器樂套曲，但由於鑼鼓的份量加重，因而以十番鑼鼓命名。在十番鑼鼓中鑼鼓單獨演奏的樂段比重大，又有了專門名稱和狀聲字譜。這部分只用鑼鼓演奏的樂段叫作清鑼鼓，俗稱素鑼鼓。

　　鑼鼓與管弦樂一齊演奏的部分，叫作絲竹鑼鼓，俗稱葷鑼鼓。這些在民間廣為流傳的鼓樂，鑼鼓部分雖然還在套曲之中，但已自成體系，並獨立地進行演奏了。清朝初年，陜西、山西、河南、江浙等地區的廣大農村和早期發達的城鎮及少數民族地區，便出現了形式多樣的清鑼鼓。