台灣位於歐亞大陸板塊與菲律賓板塊的銜接處，地質作用頻 繁。此外台灣在很早以前的古生代後期，是一個沉積岩屑、沉積 物的地槽，受到長期的沉積作用、變質作用、造山運動、陸地隆 起下沉及海昇海降等的交互作用，形成目前複雜的地質構造。台 灣島最近一次隆起是在距今約二至三百萬年前的上新世至更新世 間，因受到蓬萊造山運動的地殼運動作用，而由海中昇起。

　　玉山國家公園居台灣中央，最古老的地層在中央山脈東側， 為變質岩基盤之大南澳雜岩，這也是台灣最古老地層的一段。大 南澳雜岩層約形成於一至三億年前的古生代後期至中生代，此處 沉積了大量的火成岩、砂岩、頁岩及石灰岩，並受到造山運動的 影響，發生強烈的變質作用，因而形成變質雜岩系，主要岩石有 黑色片岩、綠色片岩、矽質片岩及大理石。

    台灣變質板岩系之新高群、亞變質板岩系之廬山群及亞變質 板岩系之畢祿山群均為中生代或第三紀初期的沉積地層。此時期 ，原為陸地的臺灣島又再度下沉，成為第三紀地層的沉積場所。 最先沉積巨厚的灰黑色頁岩、泥岩，間夾有砂岩互層，這些岩層 經過變質作用，泥質岩層變成硬頁岩、板岩及千枚岩；砂岩則變 成石英岩。國家公園區中央山脈之馬博拉斯山、秀姑巒山至關山 、新康山均屬亞變質板岩系之畢祿山群，佔國家公園約二分之一 的面積：八通關至中央、白洋金礦及八通關至南營地之間屬亞變 質板岩系之廬山群：而著名的塔塔加鞍部一玉山群峰一八通關一 雲龍瀑布附近則屬於變質板岩系之新高群。

　　塔塔加鞍部與沙里仙溪以西地區，是國家公園最年輕的地質 區，為中新世之末變質沉積岩區，屬南莊層，主要岩性為砂岩、 深灰色頁岩或砂頁岩互層，並夾含有鐵質結核及碳質碎屑物。

　　此外，本區由於受板塊運動的影響，岩層脆弱，斷層、節理 、褶皺等地質構造非常發達。變質作用促使岩石劈理、片理格外 明顯，也大大降低岩層抗風化的能力，因而形成許多驚險的崩崖 、斷崖地形，如大峭壁、主峰下碎石坡、主峰至八通關之荖濃三 斷崖、父子斷崖、關山大斷崖等。而在南橫公路及玉山景觀公路 （省18號公路）兩旁的岩壁上更司清晰的觀察到壯觀的褶皺、 斷層現象，是極佳的地質實習場所，惟觀察時要格外小心落石。

玉山主峰北壁節理發達、板岩劈理垂直切割、風化、形成一瀉千丈的碎石坡。