按慈濟宮又稱保生大帝廟，主祀吳真人，或稱為大道公。吳真人原名吳本，宋仁宗（11世紀）時，泉州府同安縣人，精於醫術，以活人為心，以藥方濟人，廉恕不苟取，遠近皆以為神，死後，鄉里人士肖像建廟祀之，部使者請示廟額，上勒賜「慈濟」，後歷任皇帝勒封為「忠顯」、「英惠侯」等，自是廟宇遍於漳，泉之間，而台灣昔為瘴癘之地，且鄭氏及諸將士皆漳泉人士，因此信仰獨盛，建廟亦早。

　　慈濟宮流傳「大道公蕹菜把」傳奇，每年中元節普渡，家家戶戶以蕹菜把掛在門外致祭，神前桌頂則置蕹菜把、五牲粿、水果等供品，以為祭祀，這種供奉蕹菜把之祭典，至今仍盛傳於民間。

　　此外左營民間鄉土俚語稱：「一、大道公蕹菜把是城內慈濟官；二、左營牲禮是元帝廟；三、店仔頂豬是慈德宮；四、埤仔頭戲是福德祠；五、廓後響啐是北極殿。」可見慈濟宮在左營居民心目中地位的重要性。

　　1937年（昭和12年），蘆溝橋事變爆發，中日兩國開戰。1938年（昭和13年）日軍將左營萬丹港建軍港，作為南進基地。而居制高點的龜山、舊城遂於1940年（昭和15年）被畫為軍區，城內居民被迫遷出，慈濟宮之保生大帝神像，得暫安置於內惟鎮安宮，虎爺則移遷至鳳山五甲周安心處奉祀。

　　1960年（民國49年）左營耆老於蓮潭九號現址重建慈濟宮，並迎奉保生大帝、虎爺諸神，至今香火鼎盛，成為當地居民守護神。