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清水巖清水祖師廟於乾隆五十二年開始建廟,五十三年興工,五十五年落成。但在嘉慶二十二年六月八日因暴風雨而遭損毀;翁有來向鄉人募捐五千元重建。咸豐三年,頂下郊分類械鬥時,又被頂郊人焚毀。董事白其祥再向安溪人募銀兩萬五千元,同治六年四月八日二度整修,至光緒初年竣工;光緒帝更賜匾額「功資拯濟」懸於中殿保存。
大家相信,清水祖師是相當靈驗的;在光緒年間,有一次發生了地方瘟疫,死者不計其數,但躲進清水祖師廟的民眾都安然無恙,事情傳開後,遠近地方便吸引了大批進香人潮。