九份的氣候屬於台灣北部的氣候之一環，但又剛好位於東北季風的風口位置，某些特微則更為鮮明。
以風來說，夏季的西南季風由於南邊的山嶺阻隔，所以感覺不是很明顯，倒是陸地與海洋的相接，因受陽光照射吸熱及輻射散熱的溫差效應，使九份時常白天的風向由陸地吹向海洋，晚上則吹海風，使九份夏季的氣溫比北部較內陸地區稍低，感覺較涼爽。冬季則因山坡面臨東北季風和東北信風重疊的風口，僅管有基隆山在東北方屏障，強風的感覺依然非常冷冽。
從雨量來看，九份剛好位於台灣的多雨區，平均年雨量為五千多公厘，冬季約佔七成，夏季約佔三成，冬季以綿密長久的陰雨天著稱，可從每年十月底延續到次年三月中旬，九份恰為迎風山坡，不論東北季風威力大小，都首當其衝，無可避免，夏天雨量的主要來則是颱風，偶有雷雨，梅雨及鋒面雨的量均較小，降雨的強度則以颱風挾帶的雨量最強，陰沈綿密的冬雨則最長且最讓人難以忍受。
九份的霧為九份一大特色，常年有霧，冬天則雨霧交加，霧也成了九份人預測天候的指標。
俗話說:「春天看海港，夏天看山頭。」
如果春天的海港清晰可見，則天氣必定是晴天。如果夏天山頂上雲霧蓋頂，則必然會下雨。尤其以基隆山戴帽子為顯著的象徵。
以氣溫來看，九份附近地區的氣溫冬季平均為攝氏十五度，夏季為攝氏二十八度，但冬季因風大而潮濕，所以感覺就更冷了，夏季則因山風海風的吹拂，使晴朗炎熱的天氣涼爽不少，形成九份冬夏兩季節在氣溫及濕度感受上的強烈對比。